吉林省2009-2012年肠道病毒71型VP1编码区氨基酸位点的变异分析  被引量:4

Variation analysis of amino acid site of VP1 coding region of enterovirus 71 in Jilin Province in 2009- 2012

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作  者:周剑惠[1] 张勇[2] 王爽[1] 魏雷雷[1] 田丽敏[3] 陈超[1] 吴静[4] 曹凤瑞[1] 常新[1] 单元春[1] 田鑫[1] 程涛[1] 林琳[1] 付思美[1] 吕淑梅[1] 范明[1] 

机构地区:[1]吉林省疾病预防控制中心吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 [3]敦化市疾病预防控制中心 [4]长春市疾病预防控制中心

出  处:《中华实验和临床病毒学杂志》2013年第6期423-425,共3页Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology

基  金:国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项传染病监测技术平台项目“辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究”课题子课题“吉林省传染病病原谱流行规律研究”(编号:20012ZX10004209-003);吉林省人力资源与社会保障厅2010年度留学回国人员科学技术创新创业项目(2010-27)

摘  要:目的分析2009--2012年引起吉林省手足口病(handfootandmouthdisease,HFMD)流行的肠道病毒71型(EV—A71)的VP1区氨基酸位点的特征性变异位点。方法对2009--2012年分离于吉林省HFMD病例的70株EV—A71分离株的VPl编码区进行逆转录.聚合酶链反应,然后对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件分析VPl区氨基酸位点的变异特征以及基因亲缘关系。结果2009--2012年在吉林省分离到的70株EV—A71均属于C4a基因亚型,其中69株与2008年安徽阜阳的分离株亲缘关系最近,并且这69株病毒在VPl编码区第22位氨基酸位点均由谷氨酰胺转变为组氨酸(Q—H),与2008年安徽阜阳株一致。结论引起2009-2012年吉林省HFMD流行的EV-A71可能:来源于安徽阜阳流行株延续传播。Objective To analyze the variation of amino acid site of VP1 coding region of Enterovirus 71 in Jilin Province in 2009-2012. Methods To choose 70 EV-A71 virus strains isolated from the HFMD cases to do the RT-PCR and sequences of VP1 genes of EV-A71 strains, and analyzed the variation of amino acid site and gene phylogenetic by the software of bioedit and Mega4. 0. Results All 70 EV-A71 strains belong to C4a subgenotype in Jilin Province in 2009-2012, among them, 69 strains have the closest homology with Fuyang strain of the year of 2008, and the 69 strains have the same variation site from Q to H with that Fuyang strain in the 22th amino acid site in VP1 coding region. Conclusion The EV-A71 which caused HFMD epidemic in Jilin Province in 2009-2012 maybe from continuing transmission of Fuyang strains.

关 键 词:手足口病 肠道病毒属 氨基酸取代 

分 类 号:R440[医药卫生—诊断学]

 

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