吉林省2012年风疹野病毒分离株的基因特征分析  被引量:2

Genetic Characterization of Wild-type Rubella Viruses Isolated in Jilin Province in 2012

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作  者:王爽[1] 常新[1] 王吉[2] 丛宪玲[3] 周剑惠[1] 魏雷雷[1] 田鑫[1] 单元春[1] 朱贞[4] 

机构地区:[1]吉林省疾病预防控制中心,吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062 [2]吉林大学白求恩第二医院,长春130041 [3]吉林大学中日联谊医院,长春130033 [4]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室,世界卫生组织西太平洋区麻疹参比实验室,北京102206

出  处:《中国疫苗和免疫》2013年第6期523-525,540,共4页Chinese Journal of Vaccines and Immunization

基  金:国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项传染病监测技术平台项目“辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究”课题“吉林省传染病病原谱流行规律研究”子课题(编号:2012ZX10004209-003);吉林省卫生厅重点实验室科学研究课题(编号:2010ZC048);吉林省疾病预防控制中心青年科学研究基金(编号:2010003)

摘  要:目的了解致吉林省2012年多起风疹爆发及散发的风疹病毒(Rubella Virus,RV)的基因型和特征。方法对采集的患者咽拭子标本进行病毒分离,通过逆转录-聚合酶链反应及序列分析方法、利用生物信息学软件确定基因型。结果 30株RV核酸鉴定呈现阳性,基因型鉴定均为1E基因型,与世界卫生组织RV 1E基因型参考株、中国RV编号为RVI Dezhou(德州)CHN(China,中国)02 1E的核苷酸同源性为97.9%~98.6%,氨基酸同源性100%。结论吉林省2012年多起风疹爆发及散发均由1E基因型的RV引起,为吉林省RV分子流行病学研究提供了基础资料。Objective To understand the epidemiological and genetic characteristics of wild-type rubella viruses in many rubella outbreaks and sporadic in Jilin province in 2012. Methods Collect patients' throat swabs to isolate rubella virus, determine rubella virus genotype with reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and sequence analysis by bioinformation software. Results 30 strains of wild-type rubella virus isolated in Jilin province are 1E type. By comparison with 1E other genotype reference isolate (RVI Dezhou.CHN 02 1E), the nucleotides homology were 97.9 %-98.6%, the amino acids homology were 100% respectively. Conclusion These three rubella outbreaks and sporadic are caused by genotype IE rubella virus. The research will lay a foundation for rubella virus molecular epidemiolo^w in Jilin province.

关 键 词:风疹病毒 基因特征 序列分析 

分 类 号:R373.16[医药卫生—病原生物学]

 

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