猪圆环病毒2型CAP蛋白B细胞表位预测与分析  

Prediction and analysis of the B cell epitopes for capsid protein of porcine circovirus type 2

作　　者：吴胜昔[1] 曾政[2] 蔡家利[1] 任康康[1] 王远强[1] 梁望旺[2] 蔺露[2] 吴玉章[3] 

机构地区：[1]重庆理工大学药学与生物工程学院,重庆巴南400054 [2]重庆市动物疫病预防控制中心,重庆渝北401120 [3]第三军医大学基础部全军免疫所,重庆沙坪坝400038

出　　处：《中国兽医杂志》2014年第1期3-5,I0001,共4页Chinese Journal of Veterinary Medicine

基　　金：重庆市科技攻关计划项目(CSTC;2011AB1078);重庆理工大学博士启动基金项目(2011ZD23)

摘　　要：基于PCV2 CAP蛋白的氨基酸序列，采用Kyte-Doolittle的亲水性方案、Emini方案、Karplus方案和Jameson-wolf抗原指数方案，辅以对PCV2 CAP蛋白的二级结构柔性区域分析，并结合吴玉章氨基酸抗原指数计算方法预测CAP蛋白的B细胞表位。结果表明，最有可能的B细胞优势表位位于CAP蛋白N端第4～18，23～28，32～41，57～64，96～103，175～182区段和第224～233区段。本研究用多参数预测PCV2 CAP蛋白的B细胞表位，为多肽疫苗的设计提供理论依据。Based on capsid protein amino sequence combined with the analysis of the flexible regions of secondary structure of capsid protein, the B cell epitopes of capsid protein were predicted by methods of Kyte- Doolittle hydrophilicity plot, Emini, Karplus and Jameson-Wolf, combined with the method of amino acid average antigenic index method of WU Yu-zhang. The results showed the B cell epitopes were located at or adjacent to the N-terminal No . 4-18,23-28,32-41,57-64,85-90,96-103,156-163,175-182 and 224-233. The multi-parameters analytic method was adopted to predict the B cell epitopes for capsid protein, which might be useful to provide a theoretical basis for the design of peptide vaccines.

关 键 词：猪圆环病毒2型 CAP蛋白 B细胞表位 

分 类 号：S852.4[农业科学—基础兽医学]