正交直观分析法和新复极差法优化苦瓜SRAP反应体系研究  被引量:8

Orthogonal Design-direct Analysis and SSR for SRAP Amplification System in Momordica charantia

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作  者:刘萌芽[1,2,3] 黄如葵[2,3] 黄玉辉[2,3] 黄熊娟[2,3] 陈小凤[2,3] 冯诚诚[2] 

机构地区:[1]广西大学农学院,广西南宁530004 [2]广西农业科学院蔬菜研究所,广西南宁530007 [3]广西作物遗传改良生物技术重点实验室,广西南宁530007

出  处:《北方园艺》2014年第5期85-88,共4页Northern Horticulture

基  金:国家自然科学基金资助项目(31240060);广西壮族自治区自然科学基金资助项目(2013GXNSFDA019010)

摘  要:以苦瓜为试材,采用正交直观分析法和新复极差法相结合的方法,对影响苦瓜SRAP反应体系的5种因素(dNTP浓度、模板DNA、引物浓度、Mg2+浓度及Taq DNA聚合酶)4个水平进行优化筛选,以期优化苦瓜SRAP的PCR反应体系。结果表明:苦瓜SRAP分析的优化反应体系为20μL PCR反应体系中含有1×PCR buffer,250μmol/L dNTP,50ng模板DNA,1.2μmol/L引物,1.5mmol/L Mg2+,1.5UTaq DNA聚合酶。Taking Mornordica charantia as test material,using SSR and orthogonal design-direct analysis to optimize the four levels of five faetor (dNTP, template DNA, primer, Mg^2+, Taq DNA polymerase). The results showed that the optimum SRAP-PCR reaction system contains 1 × PCR buffer, 250 μmoL/L dNTP, 50 ng template DNA, 1.2μmoL/L primer,1.5 mmoL/L Mg^2+ ,1. 5 U Taq DNA polymerase,in a total volume of 20 μL SRAP-PCR system.

关 键 词:苦瓜 正交直观分析法 新复极差法 SRAP分子标记 

分 类 号:S642.5[农业科学—蔬菜学]

 

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