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机构地区:[1]北京大学生命科学学院蛋白质与植物基因研究国家重点实验室,北京100871 [2]清华大学生命科学学院,北京100084 [3]北京大学合成与功能生物分子中心北京大学-清华大学生命科学联合中心,北京100871
出 处:《生命科学》2014年第3期239-247,共9页Chinese Bulletin of Life Sciences
基 金:国家自然科学基金面上项目(31270838)
摘 要:假尿苷修饰是目前已知丰度最高的RNA修饰,广泛存在于多个物种的多类RNA中。作为尿苷的5位异构体,假尿苷在真核生物中的形成机制主要有两种:依赖于假尿苷合酶或是依赖于H/ACA核糖核蛋白复合体。假尿苷修饰在多个生物学过程中发挥作用,同时不同位点的假尿苷修饰具有不同的功能。而人为地在mRNA终止密码子中引入假尿苷修饰则可以使其具有编码能力,这改变了传统的中心法则。目前对于RNA中假尿苷的研究主要是通过2D-TLC及液质联用对其进行定量分析,使用CMCT标记假尿苷及RNase H和SCARLET的方法对其进行定位。Pseudouridine is the most abundant RNA modification and it is widely spread in various RNAs of many organisms. As a rotation isomer of uridine, it is formed mainly through two mechanisms: stand-alone pseudouridine synthases and Box H/ACA Ribonucleoprotein. Pseudouridylation affects many cellular processes, with distinct functions at different sites in RNA. When incorporated into mRNA artifically, nonsense codons-containing pseudouridine can be converted into sense codons. To characterize pseudouridine in RNA, 2D-TLC and LC-MS have been used for quantification purposes, while CMCT-based labeling method, RNase H-based digestion method and most recently "SCARLET" method can all be applied for mapping the pseudouridine sites in RNA.
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