水稻赤霉素缺失突变体gid2-1的基因表达谱芯片数据分析  

Microarray Data Analysis on GA Deletion Mutant gid2-1 of Rice

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作  者:刘建军[1] 赵瑜[2] 鲁琳[1] 胡月新[3] 刘慰华[4] 

机构地区:[1]昆明医科大学分子临床医学研究院,云南昆明650500 [2]昆明医科大学生物医学工程中心,云南昆明650500 [3]昆明医科大学科研实验中心,云南昆明650500 [4]云南省农业科学院粮食作物研究所,云南昆明650205

出  处:《西南农业学报》2014年第2期620-623,共4页Southwest China Journal of Agricultural Sciences

基  金:云南省应用基础研究"稻瘟病新基因Pi40广谱持久抗瘟特性的分子遗传机制"(2010ZC174)

摘  要:赤霉素是一类重要的植物激素,在高等植物生长发育的各个阶段都具有重要的调控作用。利用突变体研究赤霉素代谢和信号转导途径是目前的研究热点。文章以水稻Affymetrix表达谱芯片的数据为例,应用生物信息学方法进行数据挖掘与研究水稻gid2-1突变体与野生型差异表达基因,初步探讨赤霉素信号途径相关基因的表达调控网络。Gibberellins (GA) is a kind of essential plant hormones,which plays an important role in the growth and development stage in higher plants.Special attention has been focused on further studies on metabolism and signal transduction pathway using GA mutants.In this study,bioinformatics was used for excavation of the datasets of rice Affymetrix expression microarray.Through analyzing the expressed genes difference between of rice gid2-1 mutant and wild-type plants,the regulatory network of gibberellins signaling pathway was explored.

关 键 词:水稻 赤霉素 突变体 表达谱芯片 

分 类 号:S511[农业科学—作物学]

 

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