豆壳过氧化物酶的序列联配、二级结构预测及疏水性分析  被引量:5

Sequence Alignment,Secondary Structure Prediction and Hydrophobicity Analysis of Soybean Hull Peroxidase

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作  者:刘稳[1] 李杨[1] 段新源[1] 齐飞[1] 高培基[1] 方靖[1] 

机构地区:[1]山东大学微生物技术国家重点实验室,济南250100

出  处:《纤维素科学与技术》2001年第1期8-16,共9页Journal of Cellulose Science and Technology

基  金:国家自然科学基金 !( 2 990 60 0 5);山东大学微生物技术国家重点实验室开放基金资助项目

摘  要:利用生物大分子数据库和软件技术对豆壳过氧化物酶 (Soybeanhullperoxidase ,SHP ,EC 1 .1 1 .1 .7)进行了序列联配、二级结构预测及疏水性分析 ,通过与其它来源过氧化物酶的比较研究 ,分析了结构保守性与功能域的关系 ,从分子水平探讨了过氧化物酶活性位点结构特征。Sequence alignment, secondary structure prediction and hydrophobicity analysis of soybean (Glycine max) hull peroxidase (SHP, EC 1.11.1.7) were performed with the biological macromolecule databases and software.The relationship between conserved structure and domain function was analyzed by the comparative study of soybean hull peroxidase and other peroxidases from different sources.The local conserved structural characteristics of peroxidases were discussed atthe level of molecular biology.

关 键 词:豆壳 过氧化物酶 序列联配 二级结构 疏水性 结构域 

分 类 号:Q554.6[生物学—生物化学]

 

参考文献:

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