渗漏型UGA终止密码在植物病毒相关基因组中的作用  

Function of the Leaky UGA Codon in ssRNA Plant Virus Genomes

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作  者:魏军亚[1] 杨恭[1] 邱并生[1] 张继澍[2] 

机构地区:[1]中国科学院微生物研究所分子病毒与生物工程开放实验室,北京100080 [2]西北农林科技大学基础科学系

出  处:《生物工程学报》2001年第3期259-263,共5页Chinese Journal of Biotechnology

基  金:国家自然科学基金 !( 39770 0 34)&&

摘  要:弱毒疫苗ToMV K的复制酶基因在 2 6 70 2 6 72核苷酸处发生UGA突变 ,研究表明该突变是导致病毒弱化的主要原因。通过ToMV K复制酶的突变区与其它具有UGA渗漏终止密码的植物ssRNA病毒基因组通读结构区的分析和比较 ,发现ToMV K和其它植物病毒的UGA渗漏与通读相关基因的共同特征 :CGG基元 ,通读区的α 螺旋结构和一些疏水氨基酸残基使UGA的通读成为可能。这些渗漏与通读的特征可能才是ToMV K致弱的根本原因。可以根据这一模式 ,探讨对其它植物ssRNA的病毒如PVX、PVY。The opal mutation (UGA) at nucleotide 2670~2672 in the replicase gene of the attenuated tomato mosaic virus K(ToMV\|K)mainly contributes to the virus attenuation based on a series of studies on the viral attenuation mechanism.From analysis and comparison between the replicase gene mutation point of ToMV\|K and the related regions of all plant viruses containing the leaky UGA,we have found that some characters,including the CGG motif,α helix structure and some specific amino acids,are,presumably,able to helpfully confer the readthrough mechanism.Finally,some other ssRNA plant viruses like PVX,PVY,CMV have been analyzed.We found that their genomic modifications and viral attenuations could be explored according to the mutation mode of the ToMV\|K replicase.

关 键 词:ToMV-K 通读 植物病毒 渗漏终止密码子 致弱突变 弱毒疫苗 

分 类 号:S432.41[农业科学—植物病理学]

 

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