斜纹夜蛾核多角体病毒(SpltNPV)碱性核酸外切酶基因的序列分析  被引量:3

Cloning and Sequence Analysis of the Alkaline Exonuclease Gene of Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus

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作  者:李镇[1] 龙綮新[1] 贺雄雷[1] 郑姬 王珣章[1] 庞义[1] 

机构地区:[1]中山大学生物防治国家重点实验室昆虫学研究所,广东广州510275

出  处:《农业生物技术学报》2001年第3期233-237,共5页Journal of Agricultural Biotechnology

基  金:家自然科学基金重点项目(39730030)资助

摘  要:斜纹夜蛾核多角体病毒碱性核酸外切酶基因(alk-exo)定位于其基因组的XbaI-I片段上,克隆并测序确定了alk-exo全序列:SpltNPV碱性核酸外切酶基因的完整的读码框为1227个核苷酸,编码一长为408个氨基酸的蛋白质,在距起始密码子ATG上游 37位、 80位各有一个启动子基序TATA框,在-28位有杆状病毒晚期基因的启动子基序TAAG,在ORF终止区有加尾信号poly(A)序列AATAAA。根据核苷酸序列推导的蛋白质的分子量为47 kD,等电点为8.9,在296~312位氨基酸存在有一预期跨膜区,其中心位于304位的丙氨酸(GFYYSFGALVCVFCMK)。SpltNPV 的alk-exo氨基酸序列与其它8种杆状病毒的alk-exo同源性在37%~43%之间,且与疱疹病毒的 alk-exo基因有一定的同源性。通过对8种杆状病毒和疱疹病毒的alk-exo序列比较发现了5个保守区。s: Alkaline exonuclease gene of Spodopera litura nucleopolyhedrovirus(SpltNPV),which were cloned and sequenced, was localized in XbaI-I 5.2 kb fragment.The complete open reading frame(ORF)of the gene was 1224 nucleotide long,encoding putative protein of 408 amino acids with 47.3 kD. Sequence analysis further revealed that the 5' noncoding region had 2 baculovirus early promoter motif TATA and one late promoter motif TAAG.A polyadenylation signal(AATAAA)was contained in the traslation stop codon.A putative transmembrane helices was present at 296~312 from the N-terminus of the protein. Comparison of the homology with other 7 baculovirus alk-exo genes had been done.SpltNPV alk-exo gene showed 373% amino acid identity to other 7 baculovirus. Three conserved regions were observed based on the alignment of the amino acid sequences of 13 alk-exo genes.

关 键 词:斜纹夜蛾核多角体病毒 碱性核酸外切酶基因 序列分析 

分 类 号:S476.13[农业科学—农业昆虫与害虫防治]

 

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