采用PCR-RFLP技术对费氏中华根瘤菌的遗传多样性研究  

Study on the Genetic Diversity of Sinorhizobium fredii Using PCR-RFLP Method

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作  者:陈明周[1] 谢福莉[1] 周俊初[1] 

机构地区:[1]华中农业大学

出  处:《中国农业科学》2001年第5期572-575,共4页Scientia Agricultura Sinica

基  金:欧盟 INCO-DC ERBIC项目 ( 970 191);教育部博士学科点基金项目 ( 980 40 1)

摘  要:用西方大豆品种 Willimas和中国大豆品种黑龙 3 3从河南郑州花园口和山东潍坊多年种植大豆但未接种根瘤菌的土壤中捕集土著大豆根瘤菌。从分离株中选出 5 0株费氏中华根瘤菌 ( Sinorhizobium fredii)进行 16S r DNA和 16S- 2 3 Sr DNA IGS的 PCR- RFL P比较分析结果表明 :全部供试菌株的 16Sr DNA的 PCR产物均为一条 1.5 kb的扩增带 ,16S- 2 3 Sr DNA IGS的 PCR产物也为一条 2 .1kb的带。用 H inf 、Msp 、H ae 3种四碱基识别序列的限制酶作 RFL P分析结果表明 :供试菌的 16S r DNA酶切分析均产生相同的电泳谱带 ,表现为相同的 16S r DNA基因型 ;但其 16S- 2 3 S r DNA IGS的 RFL P分析却有较明显的差异 ,通过对酶切谱带的聚类分析 ,自动生成的树状图谱将供试菌分为Fifty strains of S.fredii were isolated and compared by using RFLP analysis of 16Sr DNA and 16S 23Sr DNA intergenic spacer(IGS) amplied by PCR. All strains produced by PCR amplification only one 1.5kb fragment of 16Sr DNA and 2.1kb fragment of 16S 23S IGS.Three restriction endonucleases,HinfⅠ,MspⅠand HaeⅢ,were used to digest 16Sr DNA and IGS DNA. No difference was revealed from 16Sr DNA and six types were presented in IGS r DNA.The dendrogram was obtained by numerical analysis based on IGS types.The results revealed that 16S 23Sr DNA IGS PCR RFLP is a powerful tool for the study on genetic diversity of Sinorhizobium fredii.

关 键 词:费氏中华根瘤菌 菌株 聚类分析 PCR-RFLP 遗传多样性 

分 类 号:S154.381[农业科学—土壤学]

 

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