6种累枝虫(Epistylis)rRNA基因18S-ITS1序列及其分子系统发育关系  被引量:2

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作  者:缪炜[1] 余育和[1] 沈韫芬[1] 张锡元[2] 

机构地区:[1]中国科学院水生生物研究所,武汉430072 [2]武汉大学生命科学院,武汉430072

出  处:《中国科学(C辑)》2002年第2期138-145,共8页Science in China(Series C)

基  金:国家自然科学基金重点资助项目(批准号:39730070)

摘  要:建立了由采自自然界中的样品、不经实验室培养而直接用于大核DNA提取和PCR反应的原位(in situ)方法;在此基础上,测定并比较了6种累枝虫(Epistylis wenrichi,E.urceolata,E.chrysemydis,E.plicatilis,E.hentscheli,E.galea)的18S-ITS1序列,结果显示:E.wenrichi,E.urceolata,E.chrysemydis,E.plicatilis和E.hentscheli间18S和ITS1区序列的碱基相似性很高,而它们与E.galea间碱基变异位点在18S区和ITS1区均高达33个以上,遗传变异度分别大于15%和23%.以多态喇叭虫(Stentor polymorphus)为外类群,利用最大简约法、最大似然法和邻接法构建了它们的系统发育树.分析指出:E.galea和其他5种累枝虫分属为两个类群,与其他5种累枝虫相比,E.galea可能较早从祖先种中分化出来;相比其他特征,大核和口围区可能与累枝虫进化的关系更为密切,是重要的系统发育特征.

关 键 词:累枝虫 RRNA基因 18S-ITS1序列 分子系统发育关系 原位方法 原生动物 分子标记 分子生物学 

分 类 号:Q959.116[生物学—动物学]

 

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