基于转录组测序技术研究道地药材当归同源基因  被引量:3

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作  者:王金权[1] 杨杰[1] 练成[1] 丁维俊[2] 李炜弘[2] 王米渠[2] 

机构地区:[1]平凉医学高等专科学校,平凉744000 [2]成都中医药大学,成都610075

出  处:《中国中医药科技》2014年第4期410-412,共3页Chinese Journal of Traditional Medical Science and Technology

摘  要:目的:通过转录组测序技术全方位、深层次挖掘甘肃岷县当归的基因组资源,并进行当归同源基因分析,为当归栽培、品种鉴定、加工、配伍及保健品开发提供理论支撑。方法:岷县现场采集当归样品,并经专家鉴定为当归品种(angelica sinensis(oliv.)diels)。采用RNA plant Plus方法提取岷归头、岷归尾的总RNA,质量鉴定合格后构建测序文库。测序文库检测合格后在Illummina HiSeq 2000测序仪上完成双端测序。采用相关生物信息学分析软件,实现研究目标。结果:①通过转录组测序技术,获取了63585个当归表达序列标签(EST),构建了当归的基因组。②在UniProt(date:2012.09)数据库中注释的30432个当归基因,分布于939种物种;其中序列分布频率较高的前5种物种为葡萄、蓖麻、毛果杨、大豆、苜蓿属。结论:当归基因组研究处于起步阶段,亟待深入研究。已注释基因主要分布于目前研究较深入的5种重要经济植物,成为当归制剂与保健品开发的分子生物学基础。

关 键 词:转录组测序技术 当归 同源基因 道地药材 

分 类 号:Q943.2[生物学—植物学]

 

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