中国肉牛单核苷酸多态性个体识别体系构建  

Construction of Individual Identification System of Cattle Single Nucleotide Polymorphism in China

作　　者：高春燕[1] 杨波[2] 尹佳锋 王瑞[1] 康彦杰[1] 郭文新[1] 张宝[1] 

机构地区：[1]西安交通大学医学部卫生部法医学重点实验室,环境与疾病相关基因教育部重点实验室,陕西西安710061 [2]西安交通大学第一附属医院检验科,陕西西安710061 [3]西安交通大学第二附属医院检验科,陕西西安710004

出　　处：《安徽农业科学》2014年第25期8513-8515,共3页Journal of Anhui Agricultural Sciences

基　　金：中央高校基本科研业务费专项资金项目(xjj2013052);西安交通大学"新教师科研支持计划";西安交通大学本科生科研训练和实践创新基金项目

摘　　要：[目的]筛选一套能用于我国肉牛进行大规模亲子鉴定的SNP体系。[方法]运用HAPMAP数据结合文献寻找可用于我国肉牛亲子鉴定的SNP位点,筛选SNP位点及确定数目,运用相关公式计算其个体识别力和筛选结果的可信度。[结果]依据筛选标准共选择出38个符合标准的SNP位点,平均多态信息含量为0.364 5,平均观察杂合度为0.478 0。[结论]经分析38个SNP位点多态信息含量、个体识别力及累计个体识别力均符合等位基因数、杂合度、个体识别力等方面的要求,可用于我国大规模肉牛厂进行SNP个体识别鉴定需求。[Objective] To screen and set up a new SNP system which can be used for large-scale cattle paternity tests.[Method] Using data from HAPMAP and literatures,we picked out SNPs and calculated their discrimination power （DP） and the credibility of the results.[Result] 38 SNPs were selected in the present study,the polymorphism information contents（PIC） were all above 0.364 5,and the average heterozygosity （Ho） was above 0.478 0.[Conclusion] The genetic information of 38 SNP meets the requirements of the number of the alleles,heterozygosity（Het） and discrimination power （DP）.Meanwhile,the established SNPs system is up to the need of individual identification and paternity tests in cattle.

关 键 词：牛 单核苷酸多态性 亲子鉴定 个体识别 

分 类 号：S188[农业科学—农业基础科学]