水稻Dwarf 14(D14)基因的生物信息学分析  被引量:4

Bioinformatics Analysis of D14( Dwarf 14) in Rice

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作  者:王闵霞[1,2] 白玉路[1] 王平[1] 向跃武[1] 蔡平钟[1] 张志雄[1] 

机构地区:[1]四川省农业科学院生物技术核技术研究所,四川成都610066 [2]中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程,北京100081

出  处:《西南农业学报》2014年第4期1347-1352,共6页Southwest China Journal of Agricultural Sciences

基  金:四川省农作物育种攻关项目项目"高新技术在水稻新材料上的创制研究"

摘  要:独脚金内酯是一种新发现的调控植物分枝的植物激素。D14(Dwarf 14)是水稻独脚金内酯信号传导途径中的一个基因,目前尚未明确D14的作用机制。为了推测D14的作用机理,本文对D14的基因及编码蛋白序列进行了相关生物信息学分析,包括构建系统进化树、亚细胞定位、预测蛋白三维结构等。推测D14可能的作用机制是直接水解SLs,并与某些有机分子共同作用介导信号的传导。Strigolactones are of a recently discovered class of plant hormone involved in branching and plant-micrebe interactions. D14 ( Dwarf 14) acts in the strigolactones signal transduction pathway and there is no information about how D14 acts. Bio-informatic analysis was done about D14 gene and D14 protein, including phylogenetie analysis of the D14 homologous protein from different plant species, prediction of subcellular localization and three-dimensional structure. D14 may directly hydrolyze SLs, and interact with some organic molecules to mediate signal transduetion.

关 键 词:独脚金内酯 D14 生物信息学 作用机理 

分 类 号:S511[农业科学—作物学]

 

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