基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发  

作　　者：葛辰[1] 凌去非[1] 李彩娟[1] 叶竹青[1] 韩晓飞[1] 王国成[1] 朱鹏飞[1] 

机构地区：[1]苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州215123

出　　处：《江苏农业科学》2014年第10期21-27,共7页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(13)2042];江苏省科技支撑计划(编号:BE2012354);江苏省水产三项工程(编号:PJ2011-62)

摘　　要：大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类,通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序,其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本,AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序,分别获得了65 536和80 786个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)突变;对2个测序样本进行表达差异的比较,获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物,进行验证分析,共获得16个有效的多态性标记。

关 键 词：大鳞副泥鳅 高通量测序 多态性标记 引物设计 

分 类 号：S917.4[农业科学—水产科学]