利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性  被引量:2

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作  者:侯新远[1] 张洪伟[1] 尹绍武[1] 张丽娟[1] 胡亚丽[1] 

机构地区:[1]南京师范大学生命科学学院/江苏省生物多样性与生物技术重点实验室,江苏南京210023

出  处:《江苏农业科学》2014年第10期37-40,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:国家星火计划(编号:2013GA690166);江苏省科技支撑计划(农业)项目(编号:BE2013441);"江苏省六大人才高峰"高层次人才项目(编号:NY-032);江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(11)1037];南京师范大学科技成果转化基金(编号:2013-02);江苏省扬州市农业科技攻关计划(编号:2012074)

摘  要:利用相关序列扩增多态性SRAP分子标记对3个河川沙塘鳢( Odontobutis potamophila)自然群体[安徽省当涂( DT)群体、浙江省余姚( YY)群体、江苏省太湖东西山( DXS)群体]进行了遗传多样性分析。从196对引物组合中筛选出11对扩增条带清晰、稳定的引物组合对3个群体进行扩增,共获得71个位点;3个群体内多态位点占比为6.90%∽24.14%,其中DT群体多态位点占比为6.90%,YY群体多态位点占比为24.14%、DXS群体多态位点占比为24.14%;群体的Nei’s基因多样性指数(H)为0.0330∽0.0939[DT(0.0330)〈YY(0.0784)〈DXS(0.0939)],群体Shannon’s 多样性指数(I)为0.0463∽0.1368[DT(0.0463〈YY(0.1206)〈DXS(0.1368)]。可见DXS群体、YY群体的多态位点占比、Nei’s基因多样性、Shannon’s多样性指数均稍高于DT群体。研究还发现,3个群体间的Nei’s无偏遗传距离为0.0363∽0.2867,遗传相似度为0.7507∽0.9644,DXS群体与YY群体的遗传距离最小(0.0363),遗传相似度最大(0.9644),亲缘关系最近。采用 UPGMA 法对3个群体进行聚类分析显示,YY群体和DXS群体聚为1支,DT群体聚为单独的1支。综合试验结果表明,3个河川沙塘鳢自然群体的遗传多样性较低。

关 键 词:河川沙塘鳢 相关序列扩增多态性 遗传多样性 多样性指数 

分 类 号:S917[农业科学—水产科学]

 

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