福州旗山野生蕉(Musa spp.,AB Group)试管苗Mn-SOD基因克隆及生物信息学分析  被引量:1

Cloning and Bioinformatics Analysis of Mn-SOD Gene from the Plantlets of a Wild Banana in Qishan Mountain of Fuzhou(Musa spp., AB Group)

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作  者:张锐[1,2] 赖钟雄[1] 

机构地区:[1]福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州350002 [2]三明市农科院,福建三明365509

出  处:《热带作物学报》2014年第11期2215-2222,共8页Chinese Journal of Tropical Crops

基  金:国家香蕉产业体系专项资金(No.CARS-32-11);福建省农业科技平台(No.2008N2001);国家科技支撑计划(No.2007BAD07B01)

摘  要:以旗山野生蕉(Musa spp.,AB group)试管苗幼嫩叶片为材料,利用RT-PCR结合RACE技术克隆获得野生蕉试管苗Mn-SOD基因c DNA序列。结果表明:旗山野生蕉Mn-SOD的c DNA全长序列共831 bp,其中5′UTR为137 bp,3′UTR为151 bp,3′端含有17个poly(A)尾。开放阅读框(ORF)共有543个碱基组成,编码181个氨基酸。蛋白理化性质预测结果显示:Mn-SOD蛋白分子量为20 108.8 u,等电点7.92,属于碱性蛋白。The young leaves of in vitro plantlets of a wild banan (Musa spp., AB group)grown in Qishan Mountain of Fuzhou were used as the materials to clone Mn-SOD gene by RT-PCR and RACE technology. The full-length cDNA sequence was 831 bp, containing 137 bp 5'UTR, 543 bp open reading frame, encoding 181 amino acids, 151 bp 3'UTR, and 3'-end involved 17 poly(A)tails. The prediction of protein's physical and chemical properties showed it belonged to a basic protein with 20 108.8 u and pi7.92.

关 键 词:旗山野生蕉(Musa spp. AB Group) 试管苗 基因克隆 Mn—SOD基因 生物信息学分析 

分 类 号:Q943.2[生物学—植物学]

 

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