基于优化特征参量的蛋白质βαβ模体识别分析  

作　　者：姜雪[1] 于巍[1] 

机构地区：[1]沈阳工业大学辽阳校区基础部,辽宁辽阳111003

出　　处：《江苏农业科学》2015年第2期20-23,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：辽宁省教育厅教学改革立项(编号:2012411)

摘　　要：选取了来自1 423个相似性小于33%的蛋白质序列的1 459个βαβ模体和2 419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和独立检验方法对算法进行检验,识别总精度分别达到79.4%和78.6%。

关 键 词：蛋白质 βαβ模体 离散增量 优化的参量 优化位点氨基酸 识别精度 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]