麦洼牦牛TF基因的克隆及蛋白质结构分析  被引量:5

Cloning and protein structure analysis of transferrin gene in Maiwa yak

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作  者:段荟芹 王利[2] 李键[1] 钟金城[1] 字向东[2] 江明锋[2] 熊显荣[2] 李雪峰[2] 

机构地区:[1]西南民族大学青藏高原研究院,四川成都610041 [2]西南民族大学生命科学与技术学院,四川成都610041

出  处:《生物技术》2015年第1期13-16,共4页Biotechnology

基  金:中央高校基本科研业务费专项资金项目(No.2014NZYQN45);国家民委耗牛遗传资源保护与利用创新团队项目资助~~

摘  要:[目的]探讨麦洼牦牛转铁蛋白(Transferrin,TF)的结构及生理功能。[方法]采用RT-PCR方法,从麦洼牦牛心脏克隆出TF基因,并运用多种生物信息学软件对其进行核苷酸序列及蛋白质结构分析。[结果]克隆得到的麦洼牦牛TF基因开放阅读框为780 bp,编码259个氨基酸,分子质量为28.33 k Da,理论等电点8.57,不含跨膜区域,存在信号肽序列,二级结构以随机卷曲和α-螺旋为主,无β-折叠,同源建模预测出牦牛TF蛋白与猪血清转铁蛋白有相似的三级结构,同源性可达71.91%。[结论]成功克隆了麦洼牦牛TF基因并分析了其蛋白质结构,为进一步研究TF蛋白功能提供理论基础。[Objective]To explore the structure and physiological function of transferrin in Maiwa yak. [Methods]TF gene fragment was cloned from Maiwa Yak by RT-PCR,and protein structure analysis used a variety of bioinformatics softwares. [Results]Maiwa yak TF contained a 780 bp open reading frame,which encoded 259 amino acids. The molecular weight was 28. 33 k Da and theoretical IP was8. 57. The TF protein had no transmembrane regions,but had a signal peptide sequence. Its secondary structure was composed of random coil and α-helix,but no β-sheet. Homology modeling showed that TF protein of Maiwa yak had similar tertiary structure with porcine TF. [Conclusion]TF gene was obtained and protein structure was analyzed. It will benefit further study of TF function in Maiwa yak.

关 键 词:麦洼牦牛 转铁蛋白 克隆 蛋白质分析 

分 类 号:Q785[生物学—分子生物学]

 

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