随机模拟时滞生化反应系统的DRRA算法  

The DRRA for simulating biochemical reacting system with delays

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作  者:周文[1] 李远见[1] 柴甜[1] 侯高梅 

机构地区:[1]安徽师范大学数学计算机科学学院,安徽芜湖241000

出  处:《安徽工程大学学报》2015年第1期84-89,共6页Journal of Anhui Polytechnic University

基  金:国家自然科学基金资助项目(11302002);安徽高校省级优秀青年人才重点基金资助项目(2010SQRL0256ZD)

摘  要:提出了随机模拟时滞生化反应的DRRA算法,该算法在模拟有时滞的随机生化反应系统时更为有效与实用.文中用了两个具体的生化反应系统模型,分别使用DSSA算法、D-leaping算法和DRRA算法进行模拟.仿真实验结果表明,在精度损失较小的前提下,DRRA算法的模拟运行时间约为DSSA算法的45%~60%,约为D-leaping算法的60%-84%.The paper presents a DRRA for stochastic simulation of biochemical reacting system with delays,which can be more effective and practical.Two models of biochemical reaction system are illustrated and simulation is conducted using DSSA,D-leaping and DRRA respectively.Numerical results demonstrate that,with losing a little accuracy,the run time of the proposed algorithm is about 45%~60%of DSSA and 60%~84%of D-leaping.

关 键 词:时滞生化反应系统 加速随机模拟算法 DRRA算法 DSSA算法 

分 类 号:O644[理学—物理化学]

 

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