猪14-3-3蛋白家族基因生物信息学分析  

Bioinformaticsanalysis of the porcine 14- 3- 3 protein family genes

作　　者：梁小娟[1] 王志萌[1] 孟琼[1] 张凯丽[1] 徐永杰[1] 

机构地区：[1]信阳师范学院生命科学学院遗传学研究所,河南信阳464000

出　　处：《畜牧与兽医》2015年第5期31-37,共7页Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基　　金：国家自然科学基金(U1204326);河南省教育厅科学技术研究重点项目(12B230015);信阳师范学院青年骨干教师资助计划项目(2011)

摘　　要：14-3-3蛋白在哺乳动物中均有表达,是一类高度保守的酸性蛋白家族,广泛参与各种信号传导途径,具有十分重要的功能。本研究以猪的14-3-3蛋白家族为研究对象,运用生物信息学方法,首先对猪(Sus scrofa)14-3-3蛋白家族基因组数据库进行搜素,获得猪14-3-3蛋白家族的7个亚型。然后通过对所有的猪14-3-3蛋白家族的DNA序列及各种表达序列标签(Expression Sequence Tags,ESTs)作进一步比对分析。结果表明:猪14-3-3蛋白家族的7个亚型在猪中均有表达;蛋白质多序列匹配分析表明猪14-3-3蛋白存在多个保守结构域,在各功能区段相当保守;通过基因结构分析、ESTs表达分析和蛋白质预测分析表明,14-3-3蛋白质家族均为亲水性蛋白,且不同亚型在猪体内不同组织表达,参与不同的生物学功能。本文将为猪14-3-3蛋白家族进一步的功能分析提供研究基础。The 14-3-3 protein, a kind of highly conservative member of acid protein family, is expressed in mammals, which plays an im- portant role in various signal transduction pathways. In this study, the porcine 14-3-3 protein family was analyzed by bioinformatics meth- od. Firstly, seven 14-3-3 protein subtypes were identified by searching the porcine gene database. Expression analysis also showed that sev- en 14-3-3 protein subtypes were expressed in different position of pigs. Alignment of amino acid sequences suggested that porcine 14-3-3 protein had multiple conservative structure domains. Porcine 14-3-3 proteins were hydrophilic proteins, while different subtypes had differ- ent tissue expression and functional biology. This paper could be helpful in further understanding of porcine 14-3-3 protein function analy-sis.

关 键 词：猪 14-3-3蛋白 基因家族 进化分析 基因结构 

分 类 号：S828.9[农业科学—畜牧学]