大豆GmAGL8基因的克隆及生物信息学分析  被引量:3

Cloning and Bioinformatics Analysis of Gene GmAGL8 in Soybean

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作  者:李冉阳[1] 秦玉涛[1] 张倩[2] 吴婧[2] 谢皓[1] 郭蓓[2,3] 

机构地区:[1]北京农学院植物科学技术学院,北京102206 [2]北京农学院生物科学与工程学院,北京102206 [3]农业部都市农业(北方)重点开放实验室,北京102206

出  处:《安徽农业科学》2015年第18期45-48,共4页Journal of Anhui Agricultural Sciences

基  金:国家高技术研究发展计划(863)项目(2012AA101106)

摘  要:通过同源扩增从大豆中克隆得到与拟南芥AGL8基因相似的基因GmAGL8,并对该序列进行了测定。同时对GmAGL8进行了生物信息学分析,通过比对GmAGL8与桃PpMADS6和拟南芥FUL的核酸序列,相似度分别为80%和77%,三者的氨基酸序列同源性为74%。通过亲疏水性分析预测GmAGL8基因编码的蛋白为亲水性蛋白。在GmAGL8中发现与MADS基因家族相似的MEF2并找到可能对多聚体的形成有关的K-box基因。By comparing nucleotide sequences of GmAGGS with peach PpMADS6 and arabidopsis FUL, similarity were 80% and 77% respec- tively, their amino acid sequences homology of 74%. GmAGL8 gene encoding proteins is hydrophilic proteins. In soybean GmAGLS, it was found a structure named MEF2 which is similar to MADS gene families and a gene named K-box might be in the formation of polymer.

关 键 词:大豆 GmAGL8 炸荚 克隆 生物信息学 

分 类 号:S188[农业科学—农业基础科学]

 

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