青天葵甲羟戊酸激酶基因的编码蛋白预测和表达分析  

Identification and Analysis of MVK Gene in Nervilia fordii

作　　者：黄琼林[1] 何瑞[2,3] 詹若挺[2,3] 

机构地区：[1]广东医学院,广东湛江524023 [2]广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心,广东广州510006 [3]岭南中药资源教育部重点实验室,广东广州510006

出　　处：《热带作物学报》2015年第6期1099-1104,共6页Chinese Journal of Tropical Crops

基　　金：国家自然科学基金面上项目(No.30701090);教育部留学回国人员科研启动项目(教外司留[2009]1001号);广东医学院博士学位人员科研启动项目(No.B2013017)

摘　　要：甲羟戊酸途径(mevalonic acid,MVA)是植物三萜类化合物生物合成的主要途径,而甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MVK)是MVA途径中的关键限速酶之一。根据前期获得的青天葵[Nervilia fordii(Hance)Schltr.]转录组数据,采用生物信息学方法对青天葵MVK基因编码蛋白的理化特性、功能结构域、二级结构、信号肽、跨膜结构域等进行预测,并采用RPKM法分析该基因在青天葵球茎和叶片的表达量。结果表明,Nf MVK基因编码含有383个氨基酸的稳定型亲水性、酸性蛋白质,与其他植物MVK蛋白同源性可达70%。Nf MVK蛋白分子量为41.29 ku,含有甲羟戊酸激酶功能域,归属于GHMP_Kinase超级家族。该蛋白没有任何信号肽、转运肽和跨膜结构域,二级结构为混合型结构的蛋白质。Nf MVK基因在青天葵中的表达趋势为:球茎>叶片。该结果可为后续利用MVK基因调控青天葵三萜类活性成分的合成提供理论依据。Mevalonic acid （MVA） pathway is the dominant approach to fulfill the triterpenoids synthesis in plants, and mevalonate kinase （MVK） is one of key rate-limiting enzymes in MVA pathway. In this paper, one MVK gene was identified from the transcriptome data of Nervilia fordii （Hanee） Sehltr. and named as NfMVK using bioinformatics. NfMVK encoded 383 amino acids and the coding protein was a stable hydrophilic and acid protein with a molecular weight at 41.29 ku. NfMVK protein, belonged to GHMP_Kinase superfamily, contained a mevalonate kinase functional domain and none signal peptide, and transmembrane region. Secondary structure prediction revealed NfMVK was a hybrid protein. The expression level of NfMVK gene in corm was higher than in leaf. The study would provide a firm foundation for regulating the synthesis of effective triterpenoids by utilization of MVK gene in N. fordii.

关 键 词：青天葵 甲羟戊酸激酶 生物信息学 表达量 

分 类 号：R932[医药卫生—生药学]