草菇翻译起始因子Vv‐IF4E及与其共表达转录因子的研究  

Translation initiation factor Vv‐IF4E and its co‐expressed transcription factors of Volvariella volvacea

作　　者：陈仁良[1] 严俊杰[1] 陶永新[1,2] 谢斌[1] 张磊[1] 吴塔菊 李少杰[3] 谢宝贵[1] 

机构地区：[1]福建农林大学生命科学学院茵物研究中心福,建福州350002 [2]福建农林大学园艺学院,福建福州350002 [3]中国科学院微生物研究所,北京100101

出　　处：《菌物学报》2015年第4期703-711,共9页Mycosystema

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973计划)(2014CB138302);国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS24)*

摘　　要：真核翻译起始因子IF4E(initiation factor 4E)可通过与m RNA的5’帽子端结合,在蛋白质的翻译起始过程中扮演重要角色。草菇Volvariella volvacea是一种富有商业价值的食用真菌,其生长发育与蛋白质的合成代谢密切相关。本文通过鉴定草菇编码IF4E的基因(Vv-IF4E),并根据生物信息学和实时荧光定量数据分析Vv-IF4E及相关转录因子基因表达量的变化规律。结果显示,草菇Vv-IF4E基因上游存在较多顺式作用元件,基因存在4种可变剪切体,只有一种具有翻译起始因子的保守结构域。预测开放阅读框(ORF)长度为3 083bp,所编码蛋白分子量为87.1k Da,存在35个磷酸化位点。Vv-IF4E蛋白结构有异于拟南芥IF4E,但与皱木耳Auricularia delicata IF4E相似。实时荧光定量结果表明,Vv-IF4E与转录因子YRR1、ECM22存在极强的共表达规律。A gene （Vv-IF4E） encoding translation initiation factor IF4E from Volvariella volvacea was identified, and its correlating expression with associated transcription factors was analyzed by bioinformatics and RT-qPCR. Eukaryotic initiation factor 4E （IF4E） can combine with the 5＇ cap of mRNA, and plays an important role in the translation initiation process of protein synthesis. The results showed that there were many upstream cis-acting elements on Vv-IF4E. There were 4 types of alternative splicing variants, but only one （Vv-IF4E） contained an initiation factor domain. The W-IF4E coding sequence （CDS） of 3 083bp encoded a protein with a predicted molecular weight of 87.1kDa and 35 phosphorylation sites. The protein structure of Vv-IF4E differed from Arabidopsis thaliana IF4E, but showed most similarity to that of Auricularia delicata. RT-qPCR results indicated that there was a strong co-expression pattern among Vv-IF4E and its potential target transcription factors YRRI and ECM22.

关 键 词：草菇 蛋白质合成 荧光定量PCR 共表达 皮尔森相关系数 

分 类 号：S646.13[农业科学—蔬菜学]