植物AGO蛋白的结构预测分析  

Prediction Analysis of AGO Proteins Structure in Plant

作　　者：周晓馥[1] 宋明霞[1] 王晶[1] 徐洪伟[1] 

机构地区：[1]吉林师范大学植物资源科学与绿色生产吉林省重点实验室,吉林四平136000

出　　处：《吉林师范大学学报（自然科学版）》2015年第4期135-137,156,共4页Journal of Jilin Normal University:Natural Science Edition

基　　金：国家自然科学基金项目(31070224)

摘　　要：AGO蛋白家族(Argonaute protein family)是RNA诱导沉默复合物(RISC)的功能核心,参与小RNA介导的基因沉默.AGO蛋白由N末端、PAZ、MID和PIWI四个结构域组成.它和小RNA在植物中共同参与维持基因组的稳定、调控组织发育、DNA修复、对逆境的适应性应答以及在RNA层面对入侵核酸(转基因和植物病毒)的免疫.植物AGO蛋白在胚胎发育,细胞分化和转座子的沉默中具有重要作用.本文运用生物信息学的方法,结合生物信息学两大门户网站,对植物AGO蛋白的分类、平均疏水性、净电荷、不稳定系数等进行预测.AGO（ Argonaute） protein family is the key players in pathways of gene silencing and small regulatory RNAs in different organisms. AGO（ Argonaute） protein consists of four domains： N terminus,PAZ,MID and PIWI. Plant Argonaute proteins play an important role in embryonic development,cell differentiation and transposon silencing. In this paper,two web portals were used to predict the classification,average hydrophobic,net charge,instability coefficient of plant Argonaute proteins by bioinformatics methods.

关 键 词：AGO蛋白 生物信息学 分类 预测 

分 类 号：Q71[生物学—分子生物学]