6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因的克隆及序列分析  

Cloning and Sequence Analysis of SSPA Genes of Riemerella anatipestifer with Different Serotypes

作　　者：陈红梅[1] 程龙飞[1] 傅光华[1] 施少华[1] 万春和[1] 傅秋玲[1] 张丹青[1] 黄瑜[1] 

机构地区：[1]福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心，福建 福州 350013

出　　处：《福建农业学报》2015年第9期831-835,共5页Fujian Journal of Agricultural Sciences

基　　金：现代农业产业技术体系建设专项(CARS-43);福建省自然科学基金项目(2013J0101?);福建省科技计划项目--省属公益类科研院所基本科研专项(2013R1025-7);福建省种业与产业化工程项目(2011FJZY-9);福建省农业科学院青年创新基金项目(2012DVB-16)

摘　　要：为了解鸭疫里默氏菌SSPA基因的生物学信息,参照GenBank登录的鸭疫里默氏菌SSPA基因序列设计了1对特异性引物,成功克隆6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因,并利用生物信息学软件DNAstar及在线分析工具SignalP V4.0、TM-HMM Server V.2.0、NetNGly c1.0、YinOYang 1.0和NetPhos 2.0对推导的氨基酸序列进行分析。结果显示：该基因的ORF全长1 692bp,可编码563个氨基酸;氨基酸序列含有1个潜在的N-糖基化位点,1个潜在的O-糖基化位点,以及38个潜在的磷酸化位点（包括12个丝氨酸、9个苏氨酸和17个酪氨酸位点）,无跨膜区;该蛋白信号肽切割部位位于第19位的A（丙氨酸）和第20位的Q（谷氨酰胺）之间;6种血清型鸭疫里默氏菌SSPA基因的核苷酸同源性为95.7%~100.0%,氨基酸同源性为98.2%~100.0%。SSPA genes of six serotypes of Riemerella anatipestifer were amplified with specific primers by PCR.DNA sequencing confirmed that SSPA gene has a ORF（1692bp）,encoding 563 amino acid.Molecular analysis of SSPA genes was performed by DNAstar,SignalP V4.0,TM-HMM Server V.2.0,NetNGly c1.0,YinOYang 1.0and NetPhos 2.0.The results showed that the amino acid encoded by the SSPA gene contains one potential N-glycosylation site,one potential O-glycosylation site and 38 potential phosphorylation sites（including 9serine,12 threonine and 17 tyrosine sites）,there is no transmembrane area,the signal peptide protein cutting part is between A（ala）in the 19 th and Q（glutamine）in the 20 th.The nucleotide homology of SSPA among different serotypes of Riemerella anatipestifer was 95.7%-100.0%,and amino acid homology was 98.2%-100.0%.

关 键 词：鸭 疫里默氏菌 SSPA基因 克隆 序列分析 

分 类 号：S852[农业科学—基础兽医学]