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机构地区:[1]华中科技大学公共卫生学院,武汉430030 [2]华中科技大学生命科学与技术学院,武汉430074
出 处:《生物技术通报》2015年第11期27-34,共8页Biotechnology Bulletin
摘 要:长链非编码RNA(lnc RNA)是一类长度大于200个核苷酸,且不表现出任何蛋白质编码潜能的RNA。最新研究表明,lnc RNA广泛地参与动植物的生长发育及疾病的发生发展等各种生物学过程,具有类型多、数量大且作用范围广等特点。目前对于lnc RNA的发现、预测方法、功能及与疾病的关系已有了一系列报道。主要对lnc RNA相关SNP文献进行综述,并对lnc RNA相关SNP的鉴定与功能预测方法进行介绍。对其中涉及的生物信息学方法及相应的数据库进行全面综述,旨在为lnc RNA研究提供新的思路,对复杂疾病的预测、诊断和治疗提供新的依据。Long non-coding RNA(lnc RNA)is a class of RNA, whose length is greater than 200 nucleotides and it does not show any protein-coding potential. The latest research shows that lnc RNA plays function widely in the development of plants and animals, as well as in various diseases. There have been a series of reports on the discovery, prediction method, function study of lnc RNA. Here, we reviewed the study of lnc RNA related SNPs, including their identification and functional prediction. A comprehensive review of the bioinformatics methods and databases about the lnc RNA related SNP was provided. These reviews may help to provide a new point of view for lnc RNA research and a hint for the prediction, diagnosis and treatment of complex diseases based on lnc RNA.
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