微小RNA靶基因预测及功能分析方法综述  

作　　者：王志平[1] 陈海魁[2] 张湘宁[1] 王巧玲[3] 何志巍[1] 

机构地区：[1]广东医学院中美肿瘤研究所,广东东莞523808 [2]北方民族大学生物科学与工程学院,宁夏银川750021 [3]天津师范大学生命科学学院,天津300387

出　　处：《生物学通报》2016年第1期5-9,共5页Bulletin of Biology

基　　金：宁夏高等学校科学研究资助项目(NGY20140155)

摘　　要：miRNA主要的功能是与靶标miRNA的3′或5′非翻译区甚至CDS区进行不完全不精确的碱基配对,从而抑制信使RNA(miRNA)的翻译或降解miRNA。然而,目前对大多数mi RNA的调节机制及其结合的靶基因知之甚少。基于计算生物学的mi RNA靶基因预测提供了一种有效且经济的分析方法,对目前几个典型的mi RNA靶基因的生物信息学分析方法进行了系统阐述,详细论述了mi RNA靶基因的预测方法和靶基因下游的生物信息学分析,包括mi RNA差异筛选、靶基因预测、靶基因富集分析、mi RNA和靶基因相互作用网络的构建、mi RNA与通路的网络构建等,系统论述了mi RNA差异表达的分析方法和步骤,为实验验证结果提供了可靠的参考方法,为开展mi RNA的功能分析和实验研究提供借鉴。

关 键 词：MIRNA 靶基因预测 功能分析 

分 类 号：Q811.4[生物学—生物工程]