基于锁式探针技术的菜豆晕疫病菌检测技术研究  

Detection of Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola using a padlock probe-based assay

作　　者：李志锋[1] 王忠文[1] 冯建军[2,3] 郑耘[2,3] 王颖[2,3] 李一农[2,3] 章桂明[2,3] 

机构地区：[1]广西大学农学院,广西南宁530004 [2]深圳市检验检疫科学研究院深圳市外来有害生物检测技术研发重点实验室 [3]深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心

出　　处：《植物检疫》2016年第2期63-68,共6页Plant Quarantine

基　　金：深圳市海外高层次人才创新创业专项资金项目(KQC201109050077A);深圳出入境检验检疫科研项目(SZ2011002)

摘　　要：根据菜豆晕疫病菌的一段特异促旋酶亚组B（gyr B）基因序列,设计锁式探针和扩增引物,优化体系反应条件,建立了基于锁式探针菜豆晕疫病菌滚环扩增特异性检测体系。试验结果表明该检测体系能够从供试菌株中特异性检测出菜豆晕疫病菌。该体系检测DNA的阈值为600 fg/μL,与传统PCR相当;检测菌悬液检测阈值1.3×10~3 cfu/m L,比传统PCR高10倍,在模拟样品检测中也显示了更适合于样品的检测。The padlock probe and universal primer pair were designed based on the sequence of the DNA gyrase subunit B（gyr B） in Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola（PSPH）,and we optimized to develop the specific detection system of rolling circle amplification based on the padlock probe for Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola. Results showed that the padlock probe was specific for PSPH,and failed to react to the other strains using rolling circle amplification. Compared with classical PCR,this assay has a higher sensitivity,which the detection limit of pure DNA and cell suspension was 600 fg/μL and 1.3×10^3cfu/m L respectively.

关 键 词：菜豆晕疫病菌 锁式探针 滚环扩增 检测 

分 类 号：S41-30[农业科学—植物保护]