禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析  

Bioinformatics Analysis on G Protein-coupled Receptors in Colletotrichum graminicola

作　　者：韩长志[1] 任文来[2] 

机构地区：[1]西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224 [2]廊坊市文安县农业局,河北廊坊065800

出　　处：《西南林业大学学报（自然科学）》2016年第4期82-87,共6页Journal of Southwest Forestry University：Natural Sciences

基　　金：国家自然科学基金项目(31560211)资助;云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004)资助;云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y330)资助;云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505)资助;云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(2014015)资助

摘　　要：基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,通过SMART保守结构域及遗传关系分析。结果表明:发现该菌存在4个典型的GPCR;4个GPCR在蛋白质二级结构上均含有典型的7跨膜结构域以及较高比例的α螺旋结构,均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上;该菌中的GPCR与C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系。Based on three typical GPCR sequences have been reported in Saccharomyces cerevisiae, to compare and search the protein databases of Colletotrichum spp. with the Blastp as well as the use of keywords, and four typical GPCRs are identified by conserved domain analysis in the SMART online. Meanwhile, there is seven transmembrane domain and high proportion of helical structure in every GPCR protein in the secondary protein structure, which positioned in the plasma membrane and not contains significant signal peptide sequence. In addition, both Chigginsianum and Cfioriniae have a high sequence homology and close genetic relationship with Cgraminicola.

关 键 词：禾谷炭疽菌 G蛋白偶联受体 信号肽 二级结构 生物信息学 

分 类 号：S763.1[农业科学—森林保护学] S435.1[农业科学—林学]