拟南芥AAP基因家族的生物信息学分析  

Bioinformatics analysis of AAP gene family in Arabidopsis thaliana

作　　者：范贝 刘明晓[1] 李慧杰[1] 张雪[1] 王晓梅[2] 崔喜艳[1] 

机构地区：[1]吉林农业大学生命科学学院,作物营养代谢与调控实验室,长春130118 [2]吉林农业大学农学院,长春130118

出　　处：《生命的化学》2016年第3期372-378,共7页Chemistry of Life

基　　金：国家自然科学基金项目(31200611);吉林省科技厅重点科技攻关资助项目(20130206012NY);吉林省应用基础研究重点实验室开放课题资助项目(20130102066JC);吉林农业大学本科生科技创新基金项目(201410193035);转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX0801004B)

摘　　要：氨基酸通透酶（amino acid permease,AAP）是一种跨膜转运蛋白,广泛参与氨基酸的吸收、转运。本研究采用生物信息学方法对拟南芥AAP基因家族8个成员（编号AtAAP1~At AAP8）进行染色体定位、蛋白质理化性质、亚细胞定位、三级结构、跨膜区、基因结构及调控元件等进行分析,为探索AAP基因在拟南芥氨基酸吸收转运中的作用及进一步研究AtAAP基因家族的功能提供理论依据。Amino acid permease（AAP） is a kind of transmembrane transport protein. It is widely involved in the uptake and transport of amino acids in Arabidopsis thaliana. In this study, the chromosome location, physicochemical property, subcellular location, tertiary structure, transmembrane region, gene structure, regulation element and other basic properties of AtAAP gene family are analyzed by the bioinformatics methods. The bioinformatics analysis provides theoretical basis for studying AtAAP gene functions furtherly, and exploring the role of amino acids uptake and transport in A. thaliana.

关 键 词：拟南芥 氨基酸通透酶 基因家族 生物信息学分析 

分 类 号：Q943.2[生物学—植物学]