小麦相关功能基因的全基因组电子定位及基因注释  

In Silico Mapping and Annotation of Whole Genome Related Functional Genes in Wheat

作　　者：王长彪[1] 韩斌[2] 刘江[1] 崔婷[2] 任永康[3] 赵兴华[1] 董艳辉[1] 李亚丽[1] 唐朝晖[1] 

机构地区：[1]山西省农业科学院生物技术研究中心,山西太原030031 [2]山西大学生物工程学院,山西太原030006 [3]山西省农业科学院作物科学研究所,山西太原030031

出　　处：《山西农业科学》2016年第7期894-899,共6页Journal of Shanxi Agricultural Sciences

基　　金：山西省科技攻关项目(20130311001-8);山西省农业科学院育种工程项目(11yzgc028);山西省农业科学院育种基础项目(yzjc1201);山西省农业科学院科技攻关项目(2013GG51)

摘　　要：电子克隆技术是通过对基因组或EST序列的组装和拼接快速获得功能基因的方法。运用电子克隆技术,以小麦功能标记为探针,在小麦全基因组数据库中克隆与之相对应的小麦功能基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,运用UMN19,bx7_f_r,ZSBy9F2_R2,PPO33,Sus2_SNP_227_589L2,Pin_b_1,YP7A,cssfr7这些功能标记,可以克隆出与之相对应的功能基因。研究有助于下一步对小麦相关功能基因进行精细作图、图位克隆及分子标记辅助育种等工作。In silico cloning was a new way of gene- cloning by bioinfomatics, which developed with genome enforcementand EST project. This study cloned wheat functional gene in silico cloning technology, labeled with wheat functional markers as probes in the wheat genome database. Furthermore, bioinformatics analysis were made on these functional genes. The results showed that the functional markers of bx7_f_r, ZSBy9F2_R2, PPO33, Sus2_SNP_227_589L2, UMN19, Pin_b_1, YP7 A and cssfr7 could be cloned the corresponding functional genes. This study will contribute to the next step of wheat gene cloning, fine mapping and marker assisted breeding work.

关 键 词：生物信息学 小麦 功能基因 电子克隆 

分 类 号：S512.1[农业科学—作物学]