山羊PMEL基因生物信息学分析  

作　　者：李丽莎[1] 李祥龙[1,2] 毛艳朋 

机构地区：[1]河北农业大学,河北保定071000 [2]河北科技师范学院,河北秦皇岛066004

出　　处：《江苏农业科学》2016年第8期47-50,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：河北省高校创新团队领军人才培育计划(编号:LJRC004);河北省应用基础研究计划(编号:15962901D);河北省科技计划(编号:15226302D);河北省现代农业产业技术体系蛋鸡产业创新团队项目

摘　　要：基于生物基因组学数据库,对山羊PMEL基因进行生物信息学分析,为研究该基因的功能提供依据。根据Gen Bank中山羊PMEL基因编码蛋白序列(Gen Bank登录号:XP_005680442.1),利用Ex PASy数据库中的Prot Param、Prot Scale程序分别预测理化性质、疏水性;利用CBS Prediction Servers数据库中的Signal P、TMHMM、Protfun程序分别预测信号肽、跨膜区及其功能;利用Predict Protein、PSORTⅡPrediction、Motif Scan软件分别预测二级结构、亚细胞定位、功能位点,并对不同物种PMEL基因构建系统发育树。结果表明:山羊PMEL基因共编码685个氨基酸,属可溶性不稳定蛋白,无信号肽,在接近肽链的C-端存在1个跨膜区;二级结构以无规卷曲为主,该蛋白主要在内质网中发挥运输、结合、信号转导作用;不同物种PMEL基因的系统进化情况与生物进化过程中的动物学分类相符。山羊PMEL基因编码蛋白在生物进化中具有较强保守性,该基因结构和功能的分析为山羊PMEL基因遗传特性的进一步研究奠定了基础。

关 键 词：PMEL 山羊 生物信息 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学] S826.92[农业科学—畜牧学]