家兔MC4R和ASIP基因的多态性筛选及生物信息学分析  

作　　者：李维[1] 刘若余[1] 冯艳青 李思[1] 杜雪琴 谢海强[1] 肖超能[1] 林家栋[1] 

机构地区：[1]贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵州省铜仁市万山区电子商务局,贵州铜仁554300 [3]贵州省贵阳市花溪区第三实验学校,贵州贵阳550006

出　　处：《畜牧与兽医》2016年第11期77-82,共6页Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基　　金：贵州省科技支撑计划项目(农业攻关,黔科合NY字[2012]3013号)

摘　　要：以比利时公兔分别与加利福尼亚母兔、新西兰母兔和中国白母兔杂交兔为试验对象,用磁珠法动物基因组抽提试剂盒(血液)提取DNA并构建三组杂交兔的DNA池,采用双向测序技术对兔MC4R和ASIP基因SNPs进行筛选,结果在MC4R基因中发现了5个多态性位点:exon1-T33G、exon1-C52T、exon1-A101G、exon1-C105T、exon1-A492G,在ASIP基因中发现了2个多态位点:exon2-A185G和intron2-G64A。其中exon1-T33G、exon1-C105T、exon1-A492G为同义突变,intron2-G64A在内含子上,exon1-C52T、exon1-A101G和exon2-A185G为错义突变,分别使编码氨基酸由精氨酸(Arg)变为苏氨酸(Thr),天冬氨酸(Asp)变为甘氨酸(Gly)和组氨酸(His)变为精氨酸(Arg)。通过生物信息学对兔MC4R和ASIP基因突变前后RNA二级结构、蛋白质的二级结构和蛋白质的三级结构进行预测,其结果都有差异。

关 键 词：MC4R基因 ASIP基因 新西兰兔 加利福尼亚兔 中国白兔 SNPs 

分 类 号：S892.1[农业科学—特种经济动物饲养]