七彩虹竹4-香豆酸辅酶A连接酶基因(Ih4CL)的克隆及功能分析  

Cloning and Functional Analysis of 4 Coumarate: Coenzyme A Ligase Gene from Indosasa hispida cv. ‘Rainbow'

作　　者：孙金金[1] 朱金鑫[1] 杨宇明[2,3] 王娟[2,3] 王毅[2,3] 

机构地区：[1]西南林业大学,云南昆明650224 [2]云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室,云南昆明650201 [3]云南省林业科学院云南省森林培育与开发利用重点实验室,云南昆明650201

出　　处：《西部林业科学》2017年第1期26-31,37,共7页Journal of West China Forestry Science

基　　金：云南省基础研究重点项目(2013FA054);云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016);国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室开发基金共同资助

摘　　要：4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷类代谢途径的关键酶,在上游调控木质素代谢、黄酮代谢。本研究根据转录组数据设计的1对特异引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)方法从七彩红竹1年生红秆中克隆到4-香豆酸辅酶A连接酶基因Ih4CL,该基因包含1 677bp完整的c DNA开放阅读框,编码558个氨基酸;生物信息学方法对Ih4CL编码的氨基酸蛋白序列进行的分析表明,Ih4CL与禾本科植物4CL蛋白具有较近的亲缘关系,其中与短花药野生稻的同源性达88%;荧光定量PCR检测结果显示Ih4CL基因在七彩红竹的嫩叶中的表达量明显低于茎秆中的表达量。4-Coumarate coenzyme A ligase （4CL） is one of the key enzymes in the phenylpropanoid synthesis pathway, which produces several important secondary metabolites, such as flavonoids and lignins. In this study, a 4CL gene （ designated as Ih4CL） was obtained from the red culm of lndosasa hispida cv. ‘ Rainbow＇ by PCR with a pair of special primers designed based on the transcriptome date. The Ih4CL gene has a 1677bp open reading frame （ORF） that is predicted to encode a protein with 558 amino acids. Phylogenetic analysis showed that the Indosasa hispida cv. ‘Rainbow＇have more closer relative relationship with Poaceae plants and Ih4CL sequence shared high sequence identity （88%） with Oryza brachyantha. Real time PCR analysis showed that Ih4CL was most strongly expressed in the young white culm.

关 键 词：4-香豆酸辅酶A连接酶 七彩虹竹 基因克隆 荧光定量PCR 

分 类 号：S795.9[农业科学—林木遗传育种]