鸭疫里氏杆菌porin基因的生物信息学分析  

作　　者：么乃全[1] 张敏[2] 李新殿[3] 李茂辉[4] 徐凤宇[1] 高云航[1] 

机构地区：[1]吉林农业大学动物科学技术学院,长春130118 [2]中国兽医药品监察所,北京100081 [3]吉林农业大学中药材学院,长春130118 [4]吉林农业大学教研基地管理处,长春130118

出　　处：《黑龙江畜牧兽医》2017年第5期176-177,180,295,296,共5页Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine

基　　金：吉林省教育厅"十三五"科学技术研究项目(2016192);吉林农业大学博士启动基金项目(201405)

摘　　要：为了研究鸭疫里氏杆菌微孔蛋白(Porin)的结构与功能,试验采用PCR方法克隆了porin基因,并进行了生物信息学分析。结果表明:8种血清型的鸭疫里氏杆菌均在1 200 bp处获得目的片段,BLAST分析显示,8种血清型菌株的porin基因与ATCC 11845等菌株的同源性均达到100%;二级结构预测显示,Poirn蛋白前端存在3个α螺旋,为蛋白的信号肽部分,其余为β折叠和无规则卷曲;三级结构预测显示,Porin蛋白为8个β折叠所构成的圆桶结构,符合革兰氏阴性菌微孔蛋白的结构特点;抗原性分析显示,Porin蛋白的5个区段可能存在B细胞抗原表位。说明Poirn蛋白在鸭疫里氏杆菌菌株间具有高度同源性,且具有潜在B细胞抗原表位,Porin蛋白可用于鸭疫里氏杆菌的鉴定和疫苗的研发。

关 键 词：鸭疫里氏杆菌 微孔蛋白 克隆 生物信息学分析 二级结构 抗原性 

分 类 号：S855.12[农业科学—临床兽医学] Q78[农业科学—兽医学]