HCV RNA阳性标本PCR-荧光探针法病毒亚型未检出原因分析  被引量:1

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作  者:张立丽[1] 侯玉丽[1] 赵艳明[1] 黄雁翔[1] 于艳华[1] 娄金丽[1] 赵艳[1] 

机构地区:[1]首都医科大学附属北京佑安医院临检中心,北京100069

出  处:《临床检验杂志》2017年第4期268-270,共3页Chinese Journal of Clinical Laboratory Science

基  金:北京市医管局"扬帆计划"重点专业项目(ZYLX201711);北京市丰台区科技项目(BJYAH2015YN15)

摘  要:目的探讨血清HCV RNA阳性,但PCR-荧光探针法病毒亚型检测未检出的原因。方法收集2015年7月至2016年3月北京佑安医院临检中心分子室病毒载量>1 000 IU/m L但未测出病毒亚型的标本55例,采用基因测序方法对病毒扩增产物进行分型分析。结果 55例HCV病毒载量>1 000 IU/m L,但HCV病毒亚型未检出的标本中,其中3例为病毒载量接近病毒亚型检测下限,经测序分析为1b型2例,2a型1例;5例为检测试剂盒未覆盖亚型并且其探针位置无突变,HCV 1a型4例,6n型1例,占9.1%(5/55);47例因探针序列位置基因突变导致病毒亚型未检出,占85.5%(47/55),经测序发现其中1a型6例(6/47,12.8%),1b型32例(32/47,68.1%),2a型3例(3/47,6.4%),2b型1例(1/47,2.1%),3b型1例(1/47,2.1%),6a型2例(2/47,4.3%),1b、6q、6c混合型1例(1/47,2.1%),6n型1例(1/47,2.1%)。探针序列位置基因突变组中以HCV病毒5'非翻译区(5'UTR)204 C/T突变为主(31/47,66.0%),其次为5'UTR 168 C/A突变(5/47,10.6%)。结论病毒载量低、试剂盒覆盖的病毒亚型有限、探针对应的序列存在变异均会影响PCR-荧光探针法检测HCV基因型,其中探针序列变异是病毒亚型未测出的主要原因。

关 键 词:丙型肝炎病毒 病毒基因型 病毒变异 病毒载量 

分 类 号:R446.6[医药卫生—诊断学]

 

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