苹果MYB12基因的克隆及生物信息学分析  

Cloning and bioinformatics analysis of MYB12 gene in apple

作　　者：周兰[1] 张利义[2] 朴永振 朴宇[1] 刘冰雁 ZHOU Lan PIAO Yongzhen PIAO Yu ZHANG Liyi LIU Bingyan

机构地区：[1]延边朝鲜族自治州农业科学院,吉林龙井133400 [2]中国农业科学院果树研究所,辽宁兴城125100

出　　处：《延边大学农学学报》2017年第2期15-22,共8页Agricultural Science Journal of Yanbian University

基　　金：国家自然科学基金项目(31560548);国家863高技术研究发展计划(2011AA100204)

摘　　要：以野生型苹果"丽江山荆子"果皮为材料,利用对已公布的"金冠"苹果基因组的生物信息学分析,设计1对特异性引物,克隆了MdMYB12转录因子,其基因片段全长为1 042bp,在对其进行生物信息学分析后发现,包含873bp开放阅读框(ORF),编码290个氨基酸。对拟南芥127个MYB基因家族与所克隆的MdMYB12基因构建系统进化树发现,相对于拟南芥中其他MYB基因家族其他基因MdMYB12基因与AtMYB12、AtMYB11及AtMYB111缘关系较近处于同一进化分支上。According to the reference sequence published from apple ＇Golden Delicious＇ genome,one pair of primers was designed,and the MdMYB12 transcription factor from the ＇Malus rockii Schneid＇ fruit peel was cloned.The length of the target DNA fragment was 1 042 bp,including 837 bp open reading frame encoding 290 amino acids.The phylogenic tree constructed using amino acid sequences of the protein encoded by MdMYB12 gene and 127 Arabidopsis MYB gene family revealed that MdMYB12 gene and Arabidopsis MYB genes AtMYB12,AtMYB11 and AtMYB111were at the same evolutionary branch.

关 键 词：苹果 MdMYB12转录因子 克隆 生物信息学分析 

分 类 号：S661.1[农业科学—果树学]