SBV:基于SVG的生物信息可视化软件  

SBV:A Bioinformatics Visualization Software Based on SVG

作　　者：蔡瑞初[1] 林殷娴 艾鹏 

机构地区：[1]广东工业大学计算机学院,广州510006 [2]基迪奥生物科技有限公司,广州510006

出　　处：《计算机科学》2017年第10期33-37,50,共6页Computer Science

基　　金：NSFC-广东联合基金(U1501254);国家自然科学基金(61472089);广东省自然科学基金(2014A030306004;2014A030308008);广东省科技计划项目(2015B010108006;2015B010131015);广东特支计划(2015TQ01X140);广州市珠江科技新星(201610010101);广州市科技计划项目(201604016075)资助

摘　　要：生物信息可视化是从生物大数据中挖掘有效信息的重要手段。针对生物信息的海量性、可视化效果的精确性、各种可视化需求的多样性等挑战,设计并实现了一款基于SVG矢量图的生物信息可视化软件SBV(SVG for Bioinformatics Visualization)。SBV充分利用了SVG的可伸缩性、DOM和CSS表现形式的可定制性,实现了10余种常用的生物信息用图,可支持现有的大部分生物信息可视化,是一款易于操作的综合型生物信息画图软件。目前该软件已经在Github上开源,为后续开发更多功能奠定了较好的基础。Bioinformatics visualization is an important approach to exploit the information behind the massive biological data.In view of the challenges like massive data size,accurate visualization effect and diversified visualization requirements,we presented a bioinformatics visualization software based on SVG,called SBV（SVG for Bioinformatics Visualization）.SBV takes advantages of scalability of SVG and customizable performance form of DOM and CSS to draw a variety of bioinformatics maps.It is a maneuverable integrative bioinformatics visualization platform supporting most of existing bioinformatics visualization requirements.The software has been open source in Github,which provides good foundation for the further development.

关 键 词：生物信息 可视化 SVG 染色体图 

分 类 号：TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术]