鸡基质蛋白3基因的生物信息学分析  

作　　者：邓珊珊 嵇辛勤[1,2] 段志强[1,2] 熊建民[1] 阮涌[1,2] 赵佳福[1,2] 胡焱[1] 田宇杰 

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025

出　　处：《中国家禽》2017年第19期67-70,共4页China Poultry

基　　金：国家自然科学基金项目(31502074);贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2015]2054号);贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字[2014]10号)

摘　　要：根据GenBank已发表的鸡基质蛋白3(matrin 3)基因序列,设计合成一对特异性引物,以鸡胚成纤维细胞提取的总RNA反转录产物为模板,通过PCR扩增鸡matrin 3基因并进行克隆与生物信息学分析。测序结果表明:鸡matrin 3基因编码区全长为2 709 bp,共编码902个氨基酸,理论pI为5.79,分子质量约为100.71 ku,分子式为C_(4362)H_(6903)N_(1267)O_(1418)S_(29)。序列分析结果显示:鸡matrin 3蛋白有丰富的二级结构,以无规则卷曲和α-螺旋为主;该蛋白中包含两个锌指结构域和两个RNA识别基序,其中人、小鼠和野猪的4个功能结构域氨基酸位点相同,而在鸡matrin 3蛋白中存在多个氨基酸位点变异。核苷酸同源性及遗传进化分析发现:鸡与火鸡的matrin 3基因核苷酸同源性最高(为98.0%),并且与火鸡的亲缘关系最近。研究结果为进一步研究鸡matrin 3蛋白的生物学功能奠定了基础。

关 键 词：鸡 matrin3 克隆 序列分析 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]