湖南省健康猪群中不同基因型猪博卡病毒流行性及进化分析  

Prevalence and Phylogenetic Analysis of Multiple Porcine bocavirus Genotypes in Clinically Healthy Pigs in Hunan Province

作　　者：屈泰龙[1] 李润成[1] 罗斌宇 葛猛[1] 严美君 胡辉灿 余兴龙[1] QU Tailong LI Runcheng LUO Binyu GE Meng YAN Meijun HU Huican YU Xinglong(Veterinary Faculty, Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China)

机构地区：[1]湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128

出　　处：《华北农学报》2017年第5期136-141,共6页Acta Agriculturae Boreali-Sinica

基　　金：湖南省战略性新兴产业科技攻关类项目(2016GK4015)

摘　　要：为了解猪博卡病毒在不同年龄健康猪群中的感染情况,通过对GenBank登录的猪博卡病毒基因序列分析设计2对引物可分别扩增PBoV1/2的部分NS1基因和PBoV3/4/5的部分VP1基因。提取2016年8-12月收集自湖南5个集约化猪场2~20周龄猪共430份肛门拭子样品的DNA并进行PCR检测。PBoV阳性率为64.6%(278/430),PBoV1/2阳性率为27.2%(117/430),PBoV3/4/5阳性率为45.1%(194/430),混合感染率为7.7%(33/430),PBoV3/4/5阳性率显著高于PBoV1/2阳性率(P=0.034)。PBoV1/2在2~10周检出率高于其他周龄,但是与其他周龄猪体内检出率统计分析无显著性差异,PBoV3/4/5主要感染8~16周猪,与4周以内猪差异显著,与其他猪群差异不显著。对各型的核苷酸与参考序列核苷酸相似性分析显示PBoV1/2之间的平均相似度为85.4%,PBoV3/4/5之间的平均相似度为67.2%。PBoV在健康猪群中流行广泛且存在共同感染现象,对猪的健康尤其是肠道微生物平衡可能存在潜在影响。To evaluate the prevalence of PBoV in healthy pig in different age,primers targeting to partial NS1 gene of PBoV1/2 and VP1 gene of PBoV3/4/5 were designed based on the analysis of PBoV sequences from GenBank. Total 430 anal swab species were collected from 5 pig farms with the pig＇age of 2-20 weeks from August to December 2016 in Hunan Province. The total positive rate of PBoV was 64. 6%（ 278/430）,PBoV1/2 for 27. 2%（ 117/430）,PBoV3/4/5 for 45. 1%（ 194/430） and with 7. 7%（ 33/430） positive rate of coinfection. The mainly infection age of PBoV1/2 ranged 2-10 weeks,and PBoV3/4/5 from 8-16 weeks. The average nucleotide identity of obtained sequences and references of PBoV1/2 and PBoV3/4/5 was 85. 4% and 67. 2%,respectively. High prevalence and coinfection were observed in clinically healthy pigs,which may cause potential effect to the microbes in the gut.

关 键 词：猪博卡病毒 流行性 进化分析 混合感染 致病性 

分 类 号：S855.3[农业科学—临床兽医学]