利用ARMS-Tm-shift-qPCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq  

Detection of Wx-mq Gene for Low-Amylose Content by ARMS-Tm-shift-qPCR Technology

作　　者：陈峰 徐建第 姜明松 张全芳[2] 朱文银 李广贤 周学标 杨连群 

机构地区：[1]山东省水稻研究所,山东济南250100 [2]山东省农业科学院生物技术研究中心,山东济南250100

出　　处：《山东农业科学》2017年第10期15-19,共5页Shandong Agricultural Sciences

基　　金：国家重点研发计划项目(2017YFD0100505);国家水稻产业体系济宁综合试验站(CARS-01-60);国家科技支撑计划子课题(2015BAD01B02-1-3);山东省水稻产业体系项目(SDAIT-17-01);山东省重点研发计划项目(2017GNC11111);山东省农业科学院科技创新重点项目(2014CXZ10-5);山东省农业科学院科技创新工程项目(CXGC2016A11);山东省农业科学院重大成果培育项目(2016CGPY09)

摘　　要：Wx-mq基因是水稻低直链淀粉性状控制基因,与米饭食味品质密切相关。本研究根据水稻控制低直链淀粉含量Wx-mq基因第497位存在的G>A单核苷酸变异,将基于SYBR GreenⅠ的ARMS和Tmshift的两种实时PCR基因分型方法相结合,建立了可准确区分Wx-mq基因第497位的GG纯合、AA纯合及GA杂合三种类型的实时荧光定量PCR体系。试验表明这种基于SYBR GreenⅠ的ARMS-Tm-shift实时PCR基因分型方法无需合成探针,试验设计简单,是一种快速、简便、特异性好的基因分型方法,可用于Wxmq基因分子标记辅助育种中基因的高通量分型。Wx-mq gene is a low amylose trait controlled gene and closely relates with the eating quality of rice. According to the rice low amylose starch content control gene Wx-mq No. 497 position existing G A single nucleotide variants,two real-time PCR genotyping methods,ARMS and Tm-shift based on SYBR Green I,was combined to establish the fluorescence real-time quantitative PCR system,which could accurately distinguish the GG homozygote,AA homozygote and GA heterozygosis of Wx-mq gene No. 497 position. The experiment results showed that the ARMS-Tm-shift real-time PCR genotyping method based on SYBR Green I did not need probe synthesis with simple designs. It was a rapid,simple and specific genotyping method. It could be used in high-throughput genotyping of Wx-mq gene in molecular marker assisted breeding.

关 键 词：水稻 Wx-mq基因 低直链淀粉含量 ARMS-Tm-shift-qPCR 

分 类 号：S511.01[农业科学—作物学]