盐碱胁迫下玉米EST数据库对比分析  

作　　者：周鸣鸣[1] 王顺[1] 汪亚玲[1] 蔡洪玉 李德全[1] 谈蓉[1] 赵德兵[1] 俞晨[1] 豆长明[1] 张洁[1] 

机构地区：[1]南通大学农业部南方平原玉米科学观测站,江苏南通226019

出　　处：《江苏农业科学》2016年第2期60-62,共3页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：江苏省高校自然科学研究面上项目(编号:12KJB310009);农业部南方平原玉米科学观测站开放课题基金(编号:NT201409);江苏省博士后科研资助计划(编号:1201023B);南通大学校级课题(编号:2012002);南通大学博士启动基金(编号:03080519;03080227)

摘　　要：提取了盐碱胁迫处理的玉米YQ7-96品系3叶1心期的叶茎混合组织总RNA,运用SMART技术构建p DNR-LIB载体的cDNA文库,并随机挑选克隆进行EST序列的Blast X比对和MIPS归类分析。结果发现,在随机挑取的2个4 000个cDNA克隆测序中,95.0%的EST符合分析要求(长度大于150 bp,非rRNA),共获得3 217条拥有Blast X注释信息的EST序列,盐碱胁迫的EST数据库归类的比例信息比较接近。其中维持正常生理活动占比分别为50.63%(盐胁迫)和52.79%(碱胁迫),参与细胞内运输、细胞内信号传导、细胞防御和细胞循环和DNA代谢过程的基因分别为22.05%(盐胁迫)、19.03%(碱胁迫),参与能量代谢和转录相关的基因分别为15.77%(盐胁迫)、15.36%(碱胁迫)。本研究构建的盐碱胁迫下玉米cDNA文库及相关基因表达分析结果,为后续研究提供了基础数据。

关 键 词：玉米 盐胁迫 碱胁迫 EST 生理功能 

分 类 号：S513[农业科学—作物学]