杨树和柳树基因组共线性的可视化分析  

Visualized analysis of collinearity between poplar and willow genomes

作　　者：徐逸卿[1] 杜思源 蒋安纳[1] 王启昂 薛倚鹭 

机构地区：[1]南京林业大学信息科学技术学院,江苏南京210037

出　　处：《江苏农业科学》2018年第8期22-27,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家重点研发计划(编号:2016YFD0600101);国家重点基础研究发展计划(编号:2012CB114505);南京林业大学大学生创新训练计划(编号:2017NFUSPITP226)

摘　　要：基因的共线性分析是比较基因组学中的重要研究内容。为了研究杨柳科植物的进化机制,对杨属中的毛果杨和柳属中的簸箕柳进行基因组内和基因组间的共线性分析。在对共线性分析及其作图软件的对比分析后,采用MCScan X对杨树、柳树进行基因组内、基因组间的共线性分析,再利用VGSC针对不同的基因组内和组间共线性关系进行可视化分析,从而推测杨树向柳树进化的过程,为杨柳科植物的进化与起源提供重要的依据。

关 键 词：共线性分析 共线性可视化 物种进化 杨属 柳属 

分 类 号：Q941.2[生物学—植物学] S188[农业科学—农业基础科学]