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作 者:Yunqi Liu Xixi Li Xiaodong Dou Chao Tian Zhili Zhang Junyi Liu Xiaowei Wang 刘芸奇;李茜茜;豆晓东;田超;张志丽;刘俊义;王孝伟(北京大学医学部药学院化学生物学系天然药物及仿生药物国家重点实验室,北京100191)
出 处:《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》2018年第7期469-477,共9页中国药学(英文版)
基 金:The National Natural Science Foundation of China(Grant No.21172014,20972011 and 21042009)
摘 要:Among the structurally diverse NNRTIs, pyridinone scaffolds demonstrate high potency against HIV-1 wild type and drug-resistant strains. During the optimization of our pyridinone compound 1(LAM-trans), we found that the introduction of the N atoms in the C-4 position could dramatically improve the water solubility(7b), whereas protonation of the piperidine N atom resulted in a decrease in its hydrophobic interaction with the binding pocket. In particular, protonation altered the orientation of the alicyclic rings in the hydrophobic pocket, thus impeding the formation of key halogen bond and eventually leading to a huge change in anti-HIV-1 RT activity. These results provided theoretical and experimental basis for the subsequent structural modification of pyridinone compounds.在结构多样的非核苷类逆转录酶抑制剂中,吡啶酮类化合物对于HIV-1野生株病毒和突变株病毒均表现出了良好活性。在对课题组前期的吡啶酮类抑制剂LAM-trans进行结构改造的过程中,我们发现在4位引入氮原子可以显著改善化合物的水溶性,但是结构中哌啶N原子的质子化导致了化合物与结合口袋疏水作用力的减弱。特别的是,质子化改变了脂环在疏水口袋中的取向,进而阻碍了关键卤素键的形成并最终导致抗HIV-1逆转录酶活性的巨大改变。这些研究结果,为以后吡啶酮类化合物的结构改造提供了一定的理论基础和实验依据。
关 键 词:Pyridinone derivatives HIV-1 Reverse transcriptase Halogen bond Molecular docking study
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