基于线粒体D-loop序列的泰山赤鳞鱼多态性分析  被引量:2

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作  者:闫莉莉[1] 于杰[1] 赵富丽[1] 洪敏[1] 程妍[1] 孟超[1] 

机构地区:[1]泰山医学院生命科学学院,山东泰安271000

出  处:《科技创新导报》2017年第17期245-246,共2页Science and Technology Innovation Herald

基  金:国家级大学生创新创业训练计划项目201510439009;201610439274;201610439267;泰山医学院教育教学研究立项课题(XY2015067);泰山医学院博士基金项目(201301)

摘  要:通过对24条泰山赤鳞鱼DNA提取、PCR技术对线粒体D-loop序列进行扩增。PCR产物经纯化并进行序列测定后,得到的核苷酸片段约900 bp。运用MEGA5.10软件计算其成对序列遗传距离,并根据D-loop序列建立了邻接法(Neighbor-Joining,NJ)系统树。通过DNASP软件计算出这24个个体的遗传多样性参数其多态性参数为:多态位点数(S)为71,单倍型个数(H)为19,单倍型多样性(h)为0.96,核苷酸多样性(π)为0.011 12,平均核苷酸差异数(k)为8.739。研究发现泰山赤鳞鱼具有较高的单倍型多样性,但其核苷酸多样性较低。所构建NJ系统树拓扑结构基本一致,24个个体均形成两大分支,由于线粒体DNA属于母系遗传,由此可推断该群体的24个个体可能来源于两个不同的母系祖先。

关 键 词:赤鳞鱼 线粒体DNA D-LOOP 系统树 

分 类 号:S86[农业科学—野生动物驯养]

 

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