一种基于BLAST的多种遗传标记序列比对方法  

作　　者：赵钊[1,2] 王彤 孙洁 周勤虎 刘亚楠 胡蓉 

机构地区：[1]公安部物证鉴定中心,北京100038 [2]法医遗传学公安部重点实验室,北京100038

出　　处：《科技与创新》2017年第18期1-4,共4页Science and Technology & Innovation

基　　金：公安部科技强警基础工作专项项目"法医DNA二代测序数据批量比对关键技术研究"(编号:2016GABJC18)

摘　　要：设计并实现了一种基于BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)的生物序列比对方法,它可以应用于法庭科学多种遗传标记的检索比对。引入BLAST算法并设计合理的打分函数,使其在兼容序列多态性比如线粒体DNA比对的同时,可以有效地进行长度多态性比如常染色体STR的比对。实验表明,采用这种方法可以实现不同序列的有效比对,输出准确的有序结果集,具有较高的比对效率。

关 键 词：法庭科学DNA数据库 检索比对 局部序列比对算法 序列多态性 

分 类 号：D919.2[医药卫生—法医学]