基于RNA-seq技术分析意大利蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的高表达基因  

Analysis of highly expressed genes in Apis mellifera larval gut in response to Ascosphaera apis infection based on RNA-seq technology

作　　者：熊翠玲[1] 黄枳腱 梁勤[1] 徐细建[1] 张曌楠 骆群 刘敏[1] 陈大福[1] 郭睿[1] 

机构地区：[1]福建农林大学蜂学学院,福建福州350002 [2]江西省养蜂研究所,江西南昌330200

出　　处：《江苏农业科学》2018年第13期29-35,共7页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家现代农业产业技术体系(蜜蜂)建设专项(编号:CARS-45-KXJ7);福建省自然科学基金(编号:2013J01070)

摘　　要：对意蜂幼虫肠道组织基因进行深度RNA测序,并对高表达基因进行GO注释和KEGG分析,旨在揭示意蜂幼虫免疫抗病机制。分别取3、4、5、6日龄意蜂幼虫中肠组织抽提RNA,合成cDNA。得到的总读段数都在26 715 638条以上,有效数据达到97%以上,且测序饱和度良好,说明测序所得数据真实可信。将测序有效数据和意蜂公布DNA数据库进行比对,发现意蜂幼虫肠道中有13 789个基因有不同程度表达。选取各样本FPKM排序最前且表达水平最高的100个基因进行GO注释,这里主要涉及细胞组分、分子功能和生物学进程功能分析。利用KEGG分析显示这100个高表达基因分布在能量代谢、翻译、组装和降解以及信号转导等多条通路上。初步分析相应共有基因和特有基因在相关通路上的作用,并对意蜂幼虫肠道受球囊菌胁迫后的相关免疫机制进行一定分析。

关 键 词：RNA seq 意大利蜜蜂 幼虫肠道 高表达基因 

分 类 号：S893.3[农业科学—特种经济动物饲养]