中国南阳黄牛HDAC1基因SNP检测及与生长性状的相关性分析  

Relationship analysis between HDAC1 gene SNP assay and growth trait of Chinese Nanyang cattle

作　　者：杨颖[1,2] 陆江[3] 李湘萍[1] 佘纳[3] 唐核心 石德顺[1] 吕祁峰[2] 徐照学 

机构地区：[1]广西大学动物科学技术学院,广西南宁530004 [2]上海交通大学附属上海市第九人民医院,上海200002 [3]湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科,湖北十堰442000 [4]河南省畜牧研究所,河南郑州476800

出　　处：《江苏农业科学》2018年第16期25-30,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家肉牛牦牛产业技术体系专项(编号:CARS-38);国家教育部2016年度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目(编号:201610929005);国家教育部2012年度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目(编号:201210929004);湖北医药学院自然科学研究基金(编号:2011QDZR-2);湖北省十堰市科学技术研究与开发项目(编号:14Y13);湖北医药学院2015年学科建设资助项目(学科英才成长);2017年度湖北医药学院附属太和医院科学研究基金

摘　　要：采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3'-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率比例最大;C等位基因占多数。南阳黄牛HDAC1基因第5外显子没有多态性位点;第11外显子在第110 bp处存在A/G突变位点,为同义突变。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区存在2个突变:199 bp处的T/C多态性位点,其中TT型基因型频率> TG型;以及49 bp处的A/C多态性位点,其中AA型基因型频率> AC型。南阳黄牛HDAC1基因第11外显子基因多态性位点与其生长性状关联分析显示:AG和AA基因型群体中腰角宽、体长有显著性差异(P <0. 05),GG基因型比AG基因型群体在日增质量水平有显著提高(P <0. 05);在腰角宽、体长、日增质量上加性效应及显性效应水平显著(P <0. 05);其余性状均值在不同基因型群体中差异不显著。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区T/C(199 bp)处位点多态性与生长性状关联性分析发现,各性状在不同基因型群体的均值均无显著差异;A/G(49 bp)处位点多态性与其生长性状关联分析表明:AC和AA基因型群体中在体高、尻长、十字部高和日增质量经济性状上差异显著(P <0. 05),体长性状二者差异极显著(P <0. 01)。研究结果证实了南阳黄牛经济性状与其HDAC1基因片段中的一些SNP位点差异或多态性有关,这些SNP位点可以考虑为潜在的南阳黄牛分子育种目标位点。

关 键 词：南阳黄牛 HDAC1基因 单核苷酸多态性 生长性状 

分 类 号：S813.1[农业科学—畜牧学] S823.812[农业科学—畜牧兽医]