基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析  

Study on genetic diversity of Coilia nasus population in Lake Hongze based on mtDNA Cytb gene and D-loop sequences

作　　者：李大命[1] 张彤晴[1] 唐晟凯[1] 关浩勇 刘燕山 穆欢 黄越峰 潘建林[1] 

机构地区：[1]江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京210017 [2]南京师范大学生命科学学院,江苏南京210046 [3]江苏省洪泽湖渔业管理委员会办公室,江苏淮安223300

出　　处：《江苏农业科学》2018年第20期36-39,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：江苏省海洋与渔业资源环保项目(编号:ZYHB16-3)

摘　　要：利用线粒体细胞色素b(cytochrome b,简称Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查洪泽湖湖鲚的遗传多样性。结果表明,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性。40条Cytb基因序列检出14个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0. 762±0. 067、0. 0018 2±0. 000 28,平均碱基差异数为2. 073; 40条D-loop区序列检出54个变异位点,定义17个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0. 727±0. 078、0. 006 10±0. 001 00,平均碱基差异数为7. 378。13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0. 001~0. 004之间,17个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0. 001~0. 018之间,邻接法(neighbourjoining method,简称NJ)系统进化树显示单倍型聚为1支。Cytb基因和D-loop区序列中性检测Tajima's D和Fu's F_s结果产生的D和F_s值为负值,且Cytb基因的F_s值统计结果有极显著差异(P <0. 01)。同时,Cytb基因序列的岐点分布图呈现单峰型,均表明洪泽湖湖鲚近期经历了种群扩张。整体来看,洪泽湖湖鲚资源具有较高的遗传多样性,呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。

关 键 词：湖鲚 遗传多样性 线粒体DNA CYTB基因 控制区序列 

分 类 号：S917[农业科学—水产科学]